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武漢艾美捷科技有限公司
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閱讀：763發(fā)布時間：2021-3-12
冠狀病毒所到之處無不令人聞風(fēng)喪膽，咳咳咳~可能過了一點，不過，草木皆兵，驚弓之鳥這些詞也是沒跑了。舉個例子，你突然感到頭暈想吐，或者咳嗽的厲害，再配合體溫表一看，38.3°，然后你不會懷疑世界，你只會懷疑自己是不是感染了新-冠...
事實上，這不是你，或者一小撮人的經(jīng)歷，人都是吃五谷雜糧長大的，偶爾感個冒發(fā)個燒也挺正常的，以至于在新-冠突然風(fēng)靡全-球以后，很多人出現(xiàn)了Covid 19的體征和癥狀，不過檢測結(jié)果呈陰性，即使沒有出現(xiàn)在確診數(shù)據(jù)中，也還是可怕的，你有沒有想過，問題或許出現(xiàn)在檢測上。
那么接下來，如果有一種比現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)方法更準(zhǔn)確的檢測方法，那可就太好了。
COVID 19假陰性：
假陰性是研究人員和臨床醫(yī)生在使用當(dāng)前標(biāo)準(zhǔn)的SARS-CoV-2病毒RNA提取方法時面臨的大挑戰(zhàn)之一。
通過鼻*或其它樣本采集方法采集到樣本后，將其存儲在病毒運輸介質(zhì)（VTM）或通用運輸介質(zhì)（UTM）中。這就是挑戰(zhàn)的開始。培養(yǎng)基常常不能有效地保存病毒RNA，因為它只能在室溫下穩(wěn)定臨床樣本中的病毒RNA長達3天。這導(dǎo)致病毒RNA的快速降解/碎片化。此外，對于安全處理，VTM/UTM不能使樣品無傳染性。
病毒RNA碎片化為何那么重要？目前的RNA提取標(biāo)準(zhǔn)（基于二氧化硅磁珠的技術(shù)）不能有效地捕獲高度片段化的RNA。這是由于基于二氧化硅的技術(shù)傾向于結(jié)合更大的RNA序列。如果未*捕獲片段化的病毒RNA，則在基于qRT-PCR的檢測中產(chǎn)生假陰性COVID 19結(jié)果的可能性將大大提高。
COVID 19 RNA提取方法的比較研究：
這與COVID 19標(biāo)準(zhǔn)化工作流程中的病毒RNA提取方法不一致，因此Norgen團隊進行了一項研究，將Norgen的提取方法與基于二氧化硅磁珠的技術(shù)進行了比較。目的是確定在捕獲SARS-CoV-2片段化病毒RNA的敏感性方面，不同的RNA提取方法是否存在差異。從Boca Biolistics（FL, USA）采購了44份臨床鼻*樣本。使用FDA / EUA批準(zhǔn)的PerkinElmer?SARS-CoV-2實時RT-PCR檢測方法，對樣本進行預(yù)篩選，確認(rèn)44份樣本為SARS-CoV-2陽性。
二氧化硅OR碳化硅？
研究了兩種RNA提取方法在檢測上述44種臨床樣品中檢測SARS-CoV-2病毒RNA的準(zhǔn)確性方面的效率。
種方法是提取病毒RNA常用的方法，傳統(tǒng)的基于二氧化硅磁珠的技術(shù)（Zymo Research的Quick-DNA / RNA Viral MagBead）提取病毒RNA。第二種方法是基于碳化硅的提取方法（Norgen唾液/拭子RNA純化試劑盒）。
什么是佳的RNA純化技術(shù)？
到這里事情逐漸變得有趣起來。使用這兩種方法提取RNA，并使用Norgen的2019-nCoV TaqMan RT-PCR Kit（Cat. TM67100）進行qRT-PCR檢測，針對CDC推薦的3個基因（N1、N2和RP）。
當(dāng)比較兩種方法的qRT-PCR數(shù)據(jù)時，我們發(fā)現(xiàn)基于二氧化硅磁珠的提取方法對SARS-CoV-2真陽性樣本的假陰性率為25％。在另一方面中，和基于二氧化硅磁珠的方法相比，基于碳化硅的提取方法產(chǎn)生了對SARS-CoV-2樣本的*的真陽性率和更一致的Ct值。這些結(jié)果清楚地表明假陰性結(jié)果可以通過使用基于Norgen碳化硅（SiC）的技術(shù)而不是傳統(tǒng)的基于二氧化硅的技術(shù)來進行避免。
如何改進COVID 19檢測中RNA提取流程？
碳化硅是一種新型的RNA提取技術(shù)，具有出色的RNA結(jié)合親和力——特別是對小的、高度降解的RNA丨片段，如病毒RNA。碳化硅對所有RNA序列具有一致的結(jié)合親和力，對GC的含量或大小沒有偏見。此外，碳化硅不需要任何載體RNA或諸如*/lv仿之類的有害化學(xué)物質(zhì)。
這意味著什么？
檢測實驗室必須使用準(zhǔn)確的技術(shù)，以確?？煽繄蟾鍿ARS-CoV-2病毒感染情況?；跇?biāo)準(zhǔn)二氧化硅磁珠的提取方法可能不是檢測SARS-CoV-2準(zhǔn)確的方法，正如在研究中看到的，假陰性率為25%。
現(xiàn)在是對整個篩查工作流程的質(zhì)量進行評估的時候了——從采集生物樣本，到病毒RNA提取，再到SARS-CoV-2檢測——以終保護人口的健康和安全。
文章來源：艾美捷科技
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