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質(zhì)粒DNA的提取及電泳分析

時(shí)間:2016-5-18閱讀:585
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 在pH值為12.0~12.6的堿性環(huán)境中,在去垢劑SDS的作用下,細(xì)菌的細(xì)胞壁與細(xì)胞膜均破裂,釋放出大量的染色體DNA、RNA及質(zhì)粒DNA。此時(shí),所有雙鏈DNA解聚成單鏈,但質(zhì)粒DNA仍保持環(huán)狀。當(dāng)pH值恢復(fù)到中性時(shí),在高鹽濃度下,大分子量的染色體DNA只是部分復(fù)性,相互交織成不溶性的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),與細(xì)胞碎片、部分蛋白質(zhì)和大分子量的RNA一起沉淀,并可通過離心除去。而環(huán)狀的質(zhì)粒DNA可以*復(fù)性,溶解于上清中,從而達(dá)到初步分離的目的。
  本試劑盒采用改進(jìn)SDS-堿裂解法裂解細(xì)胞,離心吸附柱內(nèi)的硅基質(zhì)膜在高鹽、低pH值狀態(tài)下選擇性地結(jié)合溶液中的質(zhì)粒DNA,再通過漂洗液將雜質(zhì)和其他細(xì)菌成分去除,zui后以低鹽、高pH值的洗脫緩沖液將純凈質(zhì)粒DNA從硅基質(zhì)膜上洗脫。

【操作步驟】
  1.取1.5ml過夜培養(yǎng)的菌液,12000 rpm,離心30s,棄上清,盡可能倒干,收集菌體沉淀。
  2.用100μl 溶液I(50mmol/L Tris-HCl pH8.0, 10mmol/L EDTA)重懸菌體沉淀,Tip吹打至*懸浮。
  3.加入150μl 溶液II(0.2mol/L NaOH, 1% SDS),輕輕顛倒混勻4~6次,使充分菌體充分裂解,室溫放置5 min,直至溶液變得清亮。
  4.加入150μl 溶液III(4mol/L 鹽酸胍,0.5mol/L KAc pH4.2),立即溫和顛倒混勻4~6次。室溫放置5 min,12000 rpm離心10 min,小心吸取上清。
  5.加入400μl 結(jié)合緩沖液(5mol/L 鹽酸胍,20mmol/L Tris-HCl pH6.6, 37.5%乙醇)于離心吸附柱中,然后將步驟4中的上清加入吸附柱中(不要將沉淀移入吸附柱),混勻,套入收集管中,12000 rpm離心30 s,倒掉收集管中的廢液。
  6.加入750μl 漂洗液(20mmol/L NaCl, 2mmol/L Tris-HCl pH7.5, 80%乙醇)于離心吸附柱中,靜置1min ,12000 rpm離心15 s,倒掉收集管中廢液。
  7.重復(fù)步驟6一次。
  8.再次于12000 rpm空離心2 min, 盡量除去漂洗緩沖液中的乙醇。
  9.取出離心吸附柱,將其套入一個(gè)干凈的1.5ml Eppendorf管中,在硅基質(zhì)膜中央部位加入50μl洗脫緩沖液(10mmol/L Tris-HCl, 1mmol/L EDTA pH8.0),室溫放置2 min,12000 rpm離心1 min。
  10.丟棄離心吸附柱,溶液中含有目的質(zhì)粒DNA,置于4℃或-20℃保存。

【注意事項(xiàng)】
  1. 所用器具必須嚴(yán)格清洗,zui后要用雙蒸水沖洗3次,凡可以進(jìn)行滅菌的試劑與器具都要經(jīng)過高壓蒸汽滅菌,防止外源性核酸酶對DNA的降解以及其他雜質(zhì)的污染。
  2. 細(xì)菌培養(yǎng)容器用三角燒瓶,其容量至少應(yīng)為培養(yǎng)液體積的四倍,從而保證氧氣的供應(yīng)。細(xì)菌培養(yǎng)不要超過16 h,否則細(xì)菌會崩解,引起細(xì)菌大量死亡,導(dǎo)致質(zhì)粒丟失。
  3. 溶液I在用前加入RNase A,并置于4℃保存。
  4. 在堿裂解提質(zhì)粒的方法中,關(guān)鍵之一是加入溶液III的時(shí)機(jī),這決定了DNA變性與復(fù)性的時(shí)間。既要使溶液II 與染色體DNA充分作用使之變性,又要保證質(zhì)粒DNA不會因作用時(shí)間過久而發(fā)生不可逆的變性。若質(zhì)粒變性過度,將引起提取效率下降、內(nèi)切酶切割困難等一系列問題。因此,加入溶液II切忌劇烈振蕩,時(shí)間不應(yīng)超過5 mins。
  5. 加溶液溶液III離心后,倘若上清中還有微小白色沉淀,可再次離心后取上清。
  6. 本試劑盒優(yōu)點(diǎn):快速、方便;產(chǎn)量高、純度好;毒性低:采用硅基質(zhì)膜離心柱純化質(zhì)粒DNA,不需酚、氯仿抽提。

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